研究方法

1.使用Coriolis μ以300L/min的空氣流量，收集液采用PBS或VTM，體積為15ml，采樣持續(xù)10分鐘。
2.將每個(gè)樣本1.2ml無(wú)核酸酶水預(yù)熱至60°C，持續(xù)2-5分鐘，用于PureYield?結(jié)合柱的洗脫。
3.將收集的液體轉(zhuǎn)移到50ml Falcon管中。大約提取了10ml樣本（對(duì)于其他樣本體積，相應(yīng)地調(diào)整蛋白酶溶液、結(jié)合緩沖液和異丙醇的體積）。
4.根據(jù)表1添加適當(dāng)體積的蛋白酶溶液。
5.充分混合后，室溫下孵育30分鐘。
7.添加適量的異丙醇，充分混合。
8.按照Maxwell? RSC環(huán)境總核酸試劑盒技術(shù)手冊(cè)（TM663）第4A節(jié)“提取和純化”步驟，繼續(xù)進(jìn)行操作。

研究結(jié)果

Maxwell? RSC環(huán)境總核酸試劑盒與Maxwell? RSC儀器成功用于從通過(guò)Coriolis μ采集的PBS或VTM空氣樣本中純化可擴(kuò)增的病毒RNA，這些樣本中加入了滅活的流感B型病毒（FluB）和SARS-CoV-2（圖1）。
RT-qPCR檢測(cè)通過(guò)Coriolis μ采集的PBS或VTM空氣樣本中的SARS-CoV-2（SC2）和流感B型病毒RNA。空氣樣本使用Coriolis μ在PBS（點(diǎn)）或VTM（方）中收集，并加入滅活病毒，使用高劑量（每個(gè)樣本2×10^5個(gè)流感B、2×10^4個(gè)SARS-CoV-2）或中劑量（高劑量的1:10）。通過(guò)Maxwell? RSC儀器使用Maxwell? RSC環(huán)境總核酸試劑盒進(jìn)行總核酸純化，并進(jìn)行三次重復(fù)。每個(gè)洗脫液5μl進(jìn)行A. GoTaq? Enviro廢水SARS-CoV-2雙靶標(biāo)系統(tǒng)（E和N2）或B. GoTaq? Enviro RT-qPCR系統(tǒng)（Cat.# AM2010）與流感B型引物的擴(kuò)增。
同樣，Maxwell? RSC環(huán)境總核酸試劑盒和Maxwell? RSC儀器成功用于從PBS中采集的空氣樣本中純化細(xì)菌DNA。純化的DNA通過(guò)16S V3/V4宏基因組測(cè)序進(jìn)行分析。加入微生物群體標(biāo)準(zhǔn)時(shí)，檢測(cè)到預(yù)期的細(xì)菌物種和屬（圖2）。此外，一些文獻(xiàn)中僅在空氣樣本中發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌屬，包括Acinetobacter、Brevibacterium、Brevundimonas、Corynebacterium、Dermacoccus、Enhydrobacter、Kocuria、Micrococcus、Pseudomonas、Rhizobium、Streptococcus，以及本研究中獨(dú)有的Gardnerella、Nesterenkonia和Stenotrophomonas也在本研究中檢測(cè)到。
從空氣樣本中純化的細(xì)菌DNA的分類分布?？諝鈽颖臼褂肅oriolis μ在PBS中采集，加入75μl ZymoBIOMICS?腸道微生物群標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行加樣。通過(guò)Maxwell? RSC儀器使用Maxwell? RSC環(huán)境總核酸試劑盒進(jìn)行總核酸純化。使用GoTaq?長(zhǎng)PCR主混合物（Cat.# M4021）進(jìn)行所有擴(kuò)增步驟，并使用ProNex?尺寸選擇性純化系統(tǒng)（Cat.# NG2001）進(jìn)行所有純化步驟。測(cè)序文庫(kù)的制備遵循Illumina 16S宏基因組測(cè)序文庫(kù)制備指南，使用ProNex? NGS文庫(kù)定量試劑盒（Cat.# NG1201）進(jìn)行文庫(kù)定量。文庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)化并合并，使用Illumina MiSeq儀器進(jìn)行測(cè)序，并采用V3 600-cycle試劑盒。使用mothur（Schloss, P.D.等，2009）生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。

結(jié)論

結(jié)果表明，Maxwell? RSC環(huán)境總核酸試劑盒和Maxwell? RSC自動(dòng)核酸提取儀成功地從通過(guò)Coriolis μ采集的空氣樣本中純化了病毒RNA和細(xì)菌DNA。通過(guò)RT-qPCR檢測(cè)確認(rèn)了SARS-CoV-2和流感B型病毒的存在，而細(xì)菌DNA則通過(guò)宏基因組測(cè)序進(jìn)行分析，揭示了空氣樣本中常見(jiàn)的細(xì)菌種類。                
本研究強(qiáng)調(diào)了Coriolis μ采樣器在病原體檢測(cè)中的應(yīng)用潛力，并展示了分析方法的穩(wěn)健性，預(yù)示著環(huán)境監(jiān)測(cè)的前景。